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<TITLE>Opening for funded doctoral research on bacteria - diatom interactions (in France)</TITLE>
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<!-- Converted from text/rtf format -->
<P><FONT FACE="Arial">Apologies for cross-postings.</FONT>
</P>
<P><FONT FACE="Arial">ISSH members,</FONT>
<BR><FONT FACE="Arial">I have been asked to post the following announcement for funded doctoral research on the interactions between bacteria and diatoms, including domoic-acid-producing diatoms. Please contact Nathalie Bourgougnon (Nathalie.Bourgougnon@univ-ubs.fr) directly, if you are interested.</FONT></P>
<P><FONT FACE="Arial">Thank you,</FONT>
<BR><FONT FACE="Arial">Stephen</FONT>
<BR><FONT FACE="Arial">********************</FONT>
</P>
<P ALIGN=CENTER><B><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">BIOfilms PRODuctifs mixtes et leur impact sur l'environnement marin</FONT></SPAN></B></P>
<P ALIGN=CENTER><B><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">Université de Bretagne-Sud</FONT></SPAN></B></P>
<P ALIGN=CENTER><B><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines</FONT></SPAN></B></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">Les études sur les interactions entre le phytoplancton et les bactéries dans les environnements aquatiques sont nombreuses, diverses et souvent complexes (Kaczmarska et al., 2005). La capacité des bactéries d’émettre des signaux employés dans le quorum sensing et à contrôler le métabolisme cellulaire ajoute un niveau supplémentaire à la complexité du phénomène (Bassler, 1999). Les bactéries sont connues pour coloniser des surfaces macroscopiques submergées en quelques heures. Chez les bactéries marines colonisatrices, la surface d’attachement est un facteur affectant la morphologie et le métabolisme bactérien. De récents travaux attribuent des activités métaboliques très élevées chez les formes sessiles se traduisant par de nombreuses contreparties. Des activités semblables se retrouvent au niveau des populations dans certains environnements particuliers ou à certaines saisons sur des surfaces vivantes ou mortes. En revanche, les basibiontes comme le phytoplancton sont rarement soumis à l’épibiose et notamment les diatomées saines sont normalement exemptes de bactéries adhérentes. Cependant, en aquaculture, il a été mis en évidence que les diatomées benthiques qui servent de nourriture aux larves d’invertébrés forment, avec des bactéries et d'autres micro-organismes, des supports pour la fixation des larves en cours de métamorphose. De même, des agents pathogènes comme le<I> Vibrio cholerae</I>, responsable du Cholera ou l’<I>Aeromonas salmonicida</I> responsable de la furonculose chez les saumons, peuvent être véhiculés par le phytoplancton en adhérant à leur surface (Patz et al., 1996). Diverses relations écologiques entre bactéries et diatomées ont été supposées comme la concurrence, le commensalisme, le parasitisme. Les microalgues peuvent favoriser et/ou empêcher la croissance bactérienne par la production d’exsudats organiques ou de métabolites toxiques. Réciproquement, les bactéries peuvent stimuler ou inhiber la croissance des microalgues à travers la production ou la limitation de nutriments et/ou la production de substances inhibitrices (Avendan-Herrera & Riquelme, 2007).</FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">L’intérêt de l’étude des interactions bactéries/microalgues s’est récemment porté sur les blooms algaux toxiques et notamment sur le rôle possible, direct ou indirect, des bactéries adhérentes ou libres sur la production de toxines algales. Des travaux montrent que les bactéries pourraient produire des phycotoxines de façon autonome ou alors contribuer majoritairement à la production de toxines en association avec d’autres organismes. Ainsi, la présence de bactéries en culture semble augmenter la production d’acide domoïque (AD) produit par la diatomée pennée</FONT><I> <FONT FACE="Georgia">Pseudo-nitzschia multiseries</FONT></I><FONT FACE="Georgia"> (Bates et al., 1995). Peu d’études ont été consacrées aux interactions bactéries/diatomées. Ni la nature des interactions, ni les mécanismes intervenant dans l’augmentation de la production d’AD ne sont actuellement élucidés. Il parait donc judicieux de pouvoir étudier la flore bactérienne associée aux diatomées en culture afin d’identifier l’implication des bactéries et les conditions qui conduisent à une telle production de substances toxiques (bactéries libres ou adhérentes, formes intracellulaires).</FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">Le sujet de thèse proposé est donc basé sur l’utilisation de systèmes modèles (nanoparticules – bactéries) et de systèmes réels (bactéries et diatomées).</FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">L’étude des interactions aura pour objectif d’approfondir les connaissances fondamentales concernant : i) l’influence de la souche de microalgues et des souches bactériennes sur la formation de biofilms mixtes et le rôle des bactéries et des exo-produits sur l’agglutination et l’adhésion des microalgues ; ii) les variations temporelles et spatiales dans l’assemblage épibiotique des bactéries, sa composition et son abondance en milieu de culture et en milieu marin ; iii) ces substances étant en partie extracellulaires, il sera important d’étudier les conditions de leur formation au niveau de leur impact sur l’environnement marin.</FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia"> </FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">La thèse sera réalisée au Laboratoire de Biotechnologie et Chimie Marines (LBCM) de l’Université de Bretagne-Sud. Le LBCM a pour objectif d’étudier la dynamique de formation d'un biofilm via la caractérisation des structures impliquées dans l'adhésion des bactéries à une surface, la recherche des molécules de communications interbactériennes susceptibles de contribuer à la réponse concertée et adaptée au milieu des bactéries en biofilm, l’étude des propriétés physico-chimiques des bactéries et des biofilms, et de développer de nouvelles stratégies antisalissures. Dans le cadre du prochain plan quadriennal, l'accent sera mis notamment sur l'étude des interactions aux interfaces organismes-surfaces abiotiques (physico chimie, formulation, bioadhésion) et biotiques (physico chimie, régulations induites et croisées).</FONT></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><FONT FACE="Georgia">Le futur doctorant devra avoir de bonnes connaissances en culture cellulaire et en microbiologie (culture bactérienne et de microalgues) et en biochimie (identification des molécules produites, techniques d'analyse, de purification). Des bases en génie des Procédés (bioréacteurs) ainsi qu’une bonne culture scientifique en biologie et environnement marin seront des atouts supplémentaires. Naturellement, le futur doctorant devra être très fortement motivé à l’idée de mener ce projet au sein d’une équipe pluridisciplinaire. Le doctorant recevra de La Région Bretagne un salaire net de</FONT><B><FONT FACE="Georgia"><U> 15 250€/an</U></FONT></B><FONT FACE="Georgia">.</FONT><B></B></SPAN></P>
<P ALIGN=JUSTIFY><SPAN LANG="fr"><B><FONT FACE="Georgia">Clôture des candidatures au</FONT></B><B><U> <FONT FACE="Georgia">15 juillet</FONT></U><FONT FACE="Georgia">.</FONT></B></SPAN></P>
<P><SPAN LANG="fr"><B><FONT FACE="Georgia">Contacts : </FONT></B></SPAN><A HREF="mailto:nathalie.bourgougnon@univ-ubs.fr"><SPAN LANG="fr"><B><U><FONT COLOR="#0000FF" FACE="Georgia">nathalie.bourgougnon@univ-ubs.fr</FONT></U></B></SPAN></A><SPAN LANG="fr"><B><FONT FACE="Georgia"> </FONT></B></SPAN>
<BR><SPAN LANG="fr"><B><FONT FACE="Georgia">Université de Bretagne-Sud : </FONT></B></SPAN><A HREF="http://www.univ-ubs.fr"><SPAN LANG="fr"><B><U><FONT COLOR="#0000FF" FACE="Georgia">http://www.univ-ubs.fr</FONT></U></B></SPAN></A><SPAN LANG="fr"><B></B></SPAN>
<BR><SPAN LANG="fr"><B><FONT FACE="Wingdings">)</FONT><FONT FACE="Georgia"> 06.77.04.33.96</FONT></B></SPAN>
</P>
<BR>
<P><SPAN LANG="fr"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">*************************************************************</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-us"></SPAN>
<BR><SPAN LANG="fr"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Stephen S. Bates, PhD<BR>
Research Scientist - Phytoplankton /</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"> <FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Chercheur Scientifique - Phytoplancton</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
<FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Fisheries and Oceans Canada /</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"> <FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Pêches et Océans Canada</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
<FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Gulf Fisheries Centre</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"> <FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">/ Centre des pêches du Golfe</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
<FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">P.O. Box 5030 /</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"> <FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">C.P. 5030</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
</SPAN><SPAN LANG="fr-ca"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">343 Université Ave. / 343, avenue de l'Université</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
<FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Moncton, New Brunswick</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"> <FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">/ Nouveau-Brunswick</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">, Canada E1C 9B6</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-us"></SPAN>
</P>
<P><SPAN LANG="fr-ca"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Tel / Tél.: 1-506-851-3982</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
</SPAN><SPAN LANG="fr-ca"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">Fax / Télécopieur: 1-506-851-2079</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
</SPAN><SPAN LANG="fr-ca"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">E-mail / Courriel: BatesS@dfo-mpo.gc.ca</FONT></SPAN><SPAN LANG="fr"><BR>
</SPAN><SPAN LANG="fr-ca"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma">ISSHA website: </FONT></SPAN><A HREF="http://www.issha.org/"><SPAN LANG="fr-ca"></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"><U><FONT COLOR="#0000FF" SIZE=2 FACE="Tahoma">http://www.issha.org</FONT></U></SPAN><SPAN LANG="fr-ca"></SPAN></A><SPAN LANG="fr-ca"></SPAN><SPAN LANG="fr"><FONT SIZE=2 FACE="Tahoma"><BR>
Pseudo-nitzschia and domoic acid references:<BR>
</FONT></SPAN><A HREF="http://www.glf.dfo-mpo.gc.ca/sci-sci/dapr-radp"><SPAN LANG="fr"></SPAN><SPAN LANG="fr"><U><FONT COLOR="#0000FF" SIZE=2 FACE="Tahoma">http://www.glf.dfo-mpo.gc.ca/sci-sci/dapr-radp</FONT></U></SPAN><SPAN LANG="fr"></SPAN></A><SPAN LANG="fr"></SPAN><SPAN LANG="en-us"></SPAN>
</P>
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